Bipolar merupakan penyakit mental yang dapat mengalami transformasi emosional yang sangat drastis. Gangguan bipolar dapat menggangu aktivitas penderita apabila tidak dideteksi sejak awal. Penderita gangguan bipolar pada umumnya sangat sulit untuk mengkontrol keadaan atau suasana hatinya dan membutuhkan penanganan yang tepat dari seorang pakar. Sistem pakar dalam mendiagnosa jenis gangguan bipolar dibangun pada penelitian ini dengan menggunakan perbandingan metode Depmster-Shafer dan Certainty Factor berbasis website. Harapan utama dari aplikasi sistem pakar ini adalah untuk memudahkan para pakar dalam mendiagnosa jenis gangguan bipolar serta mempercepat proses konsultasi. Selain itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingan kedua metode tersebut untuk mengetahui metode yang terbaik. Hasil perhitungan akurasi pada penelitian ini yaitu perbandingan metode Certainty Factor sebesar 93% sementara itu metode Dempster Shafer sebesar 80% maka dapat disimpulkan bahwa metode certainty factor lebih baik digunakan dalam melakukan diagnosa jenis gangguan bipolar karena memiliki tingkat akurasi yang lebih tinggi.