Dua tahun setelah peristiwa The Avengers, Thor kembali ke Asgard untuk memulihkan perdamaian di sembilan dunia. Namun, gencatan senjata terancam ketika Malekith, pemimpin Dark Elves, kembali untuk mencari Aether, senjata kuno yang dapat mengubah kenyataan. Thor harus berpacu dengan waktu untuk menghentikan Malekith dan menyelamatkan alam semesta.