Sumber daya manusia di dalam suatu organisasi perusahaan merupakan hal yang sangat penting untuk mendukung kemajuan dan kualitas perusahaan dalam mencapai tujuan. Salah Salah satu kunci sukses keberhasilan organisasi adalah pegawai, yang mempunyai peranan penting sebuah organisasi, oleh karena itu manajemen sumber daya manusia pada sebuah organisasi dilakukan dengan baik agar mampu mencapai berbagi tujuan organisasi tersebut. Proses administrasi data pegawai yang berjalan di Madrasah Istiqlal Jakarta saat ini masih dilakukan manual salah satunya pengajuan cuti karyawan. Sistem manual ini memiliki banyak kekurangan yaitu penggunaan waktu yang lama, laporan yang dibutuhkan tidak lengkap, dan lebih rentan terhadap kesalahan. Proses pendataan data kepegawaian yang dilakukan secara manual akan menyebabkan data yang tersedia kurang lengkap atau hilang dan membutuhkan waktu yang lama. Oleh sebab itu dibutuhkan sistem informasi kepegawaian untuk mengatasi masalah tersebut. Sistem Kepegawaian yang baik akan menghasilkan data yang tepat dan akurat sehingga sangat mempengaruhi jalannya pengambilan keputusan. Metode waterfall mempunyai kecepatan adaptasi yang tinggi, dapat dibuat dengan cepat dan juga karena metode waterfall cocok digunakan untuk produk software yang sudah jelas kebutuhannya di awal, sehingga minim kesalahannya. Hasil dari penelitian ini adalah sebuah sistem informasi kepegawaian yang dapat membantu pegawai dalam menerima informasi dengan database yang terintegrasi.